一般纳税人常规来说成本发票中应该是专用发票占大多数，如果取得的进项发票大多是普通发票，有以下风险：

1. 税务局系统检查比对企业数据时显示异常，需要上门核实普通发票的业务真实性，以确定企业收取的普通发票非虚开。
2. 收取的普通发票开票项目与企业对外销售开具发票项目是否一一对应，如果有大量不对应的情况产生，可能有虚开发票、变名销售的嫌疑，从而引起税务局关注增加被稽查风险。
3. 一般纳税人开具增值税专用发票时，销项发票项目一般应该与进项发票项目一致，不一致的情况包括不限于以下几种。

（1）一般纳税人从事生产、施工、服务等业务，购进的是材料、人工、机械等，开出的是由这些要素组成的产品或服务，如建筑服务、培训服务等。

（2）一般纳税人从事组装销售业务，购进的是电脑配件，组装成电脑后对外开具电脑发票。

（3）一般纳税人购进需要加工的原材料，加工后对外销售。如：购进黄金加工成黄金饰品，购进原料油加工成燃料油，购进大米加工成米粉等。